Jiří Pomeje po gymnáziu vystupoval v českobudějovickém baletu a tanci se věnoval dvanáct let. Poté vystudoval DAMU. V roce 1992 založil společnost Fronda film.
Jako dabér propůjčil hlas zejména akčním hrdinům jako Jean-Claude Van Damme, Arnold Schwarzenegger a Sylvester Stallone. Hrál v několika filmech, například v Kameňáku, Playgirls, Nahotě na prodej a v Andělské tváři. Podílel se na produkci filmů Princezna ze mlejna, obou filmů Z pekla štěstí nebo Kameňák.
Jiří Pomeje byl třikrát ženatý. První manželkou byla herečka Michaela Kuklová (1994–2007). V roce 2008 si vzal za manželku zpěvačku Ivetu Bartošovou (zemřela v roce 2014 spácháním sebevraždy), se kterou byl ženatý jen krátce. Jejich sen o manželství skončil po jednom roce. Od roku 2013 byla jeho třetí manželkou dýdžejka Andrea Pomeje, rozená Andrea Šťastná. S Andreou Pomeje má dceru Annu.
Jiří Pomeje zemřel po dlouhé nemoci 26. února 2019. Poslední chvíle strávil se svým kamarádem Pavlem Páskem v Nemocnici Na Pleši. Poté byl kvůli bolestem uveden do umělého spánku, z něhož se již neprobudil.